Le Bureau Militaire est chargé de:
- traiter et suivre les dossiers de coopération en matière de défense et de sécurité dans les pays de la juridiction ;
- œuvrer à la promotion et au renforcement des relations de coopération militaire et de sécurité entre le Burkina Faso et les pays de la juridiction ;
- fournir des rapports périodiques sur l’état de la coopération militaire et de sécurité avec le(s) pays de la juridiction;
- exécuter toutes autres tâches administratives confiées par le Chef de Mission ou les Ministres en charge de la Défense ou des Affaires Etrangères.
Le Bureau Militaire et de Sécurité intérieure est dirigé par un Attaché de Défense et de Sécurité intérieure.